在使用氣相色譜儀毛細管柱分析過程中，主要是防止固定相的流失，因為固定液流失會使柱效能降低。事實上色譜柱固定液流失是自然的、是熱力學平衡過程。色譜柱固定液聚硅氧烷通過聚合物本身的取代基形成環狀分子。聚合物碎片之間由于取代基作用也可形成一些短鍵聚合物碎片。當這些碎片從色譜柱流出，它們會被檢測到，從而導致信號的增強。在氣相色譜儀毛細管柱使用的全過程中這種反應一直發生。因此，所有的色譜柱都有不同程度的柱流失。氧是導致嚴重柱流失的主要因素，在氣相色譜分析時盡量減少色譜儀氣路系統氧的含量、使用好材料的部件以及選擇正確的操作條件，可降低柱固定液的流失，延長色譜柱使用壽命。
譜析儀器色譜分析工程師介紹幾點毛細管柱使用注意事項，對延長壽命尤為重要：
① 氣相色譜儀所用的載氣必須是高純氣，氧氣含量不宜高于1×10-6g/g。
② 利用凈化器可以除去較低級別氣體中的氧和碳氫化合物雜質。通常雜質含量可減少到100×10-g/g或更少
③ 聚合物材料通常不穩定。因此，調節器主體，閥盤座，密封圈和隔膜應首選金屬材料。
④ 管線只能使用沒有油或其他污染物的銅管或不銹鋼管，推薦使用制冷級銅管。
⑤ O形圈或其他聚合物墊圈的閥最好用有焊接金屬、波紋形密封墊。
⑥ 整個系統必須無泄露，并且確保樣品中不存在非揮發性物質。因為氧和污染物對固定液的分解有催化作用，會導致柱流失增強。
⑦ 在柱子安裝后加熱柱箱之前，柱子必須用干凈的載氣清洗15min。如果色譜儀是新的，或進樣器和儀器管線進行維護或修理過，儀器應當再清洗15~30min。
⑧ 各種固定液的熱穩定性不一樣，柱流失對背景信號的影響隨固定液種類和所受溫度變化而變化。當柱箱溫度接近于柱溫的上限時柱流失也會増加。所以應當盡量在較低的溫度下工作以延長柱子的使用壽命。
⑨ 一旦柱子損壞，由于固定液降解的程度不同，重新老化后有可能改善柱性能。
