ELSD能夠測定沒有紫外吸收或為紫外末端弱吸收的樣品，天然產物中的許多成分無疑找到了直接、準確的測定方法。ELSD在天然產物及其復方成藥分析中的應用報道主要有皂苷類、生物堿類、萜類內酯等。皂苷無紫外吸收或僅為末端吸收，ELSD能夠對其不經衍生進行檢測，在HPLC—ELSD的應用中這方面的報道zui多。主要有一次性分離分析天然人參、生脈散復方、育精膠囊中的多種人參皂苷；西洋參中的人參皂苷和擬人參皂苷定量測定；三七中的三七皂苷的含量分析；黃芪、黃芪注射液和保元湯中的黃芪皂苷、黃芪甲甙的分離和測定；麥冬中的甾體皂甙元；天麻中的天麻甙的含量測定等。這些研究主要采用Cl8柱、乙晴與水作流動相，不經衍生直接測定多組分含量，結果顯示方法靈敏度高（一般檢測限低于3μg／m1）、線性關系良好。對于無紫外吸收的生物堿類成分，ELSD同樣顯示出操作簡單、靈敏度高的優點。對比HPLC—UV法測定貝母中的甾類貝母生物堿，采用ELSD檢測器，不但不需衍生化操作，提高了結果的準確度，而且可檢測出不含雙鍵的貝母甲素，對動物體內的生物堿類成分如河豚du素，無紫外吸收且安全性低，不適合衍生化法，可用ELSD法進行檢測，獲得滿意結果。銀杏作為一種保健藥品，其主要活性成分為黃酮類和萜類內酯，以往銀杏中的萜類內酯成分主要采用HPLC—UV法和HPLC—RI測定，但由于萜類內酯紫外吸收差，又含少量物質的干擾，結果穩定性和準確性較差。隨著ELSD的發展和普及，這些方法已經逐漸被ELSD法所取代。