6、明確恒流、恒壓模式
隨著柱溫箱程序升溫，色譜柱內壓力升高。
在恒壓系統中，氣相色譜儀將流量相應減少以保持恒定的柱頭壓。這樣做會推后保留時間，并因流量偏離了最佳線速度而降低效率。
在恒流模式下，儀器通過增加壓力來保持恒定柱流速（具有最佳線速度）。 保留時間更短，效率更高。
恒定壓力和恒定流量兩種模式會產生兩種不同的保留時間和峰形。因此運行前設定好哪種模式會直接影響結果。
7、避免水分進入到非極性柱
對于某些樣品類型，可能無法避免將水分帶入到柱子中， 因此需要確保您使用的色譜柱可以允許水分進入。 有些色譜柱，比如DB-1，隨著柱子逐漸變得非極性,，不再對水有吸附，進而不再具有分離能力。所以對于水分相關進樣，盡可能使用固定相極性最強的（例如Wax柱），并要接受色譜柱壽命減少和柱流失增加的結果。
色譜柱是否耐水，要仔細查看廠家說明。
8、正確選擇點火所需氣體流量比例
（1）請注意點火期間關閉尾吹氣。
（2）氫氣與空氣之間流量的比例按照廠商建議，或者使用1：10的常規比例，如30ml/min的氫氣流量加300ml/min的空氣流量。
（3）請特別注意，設定之后如有條件最好用流量計測量一下設定流量。
（4）點火成功后逐步增加尾吹氣流量。
9、注意色譜柱的存放
（1）色譜柱的固定相容易氧化，務必在存放時先通入惰性氣體后密封兩端以防止空氣進入柱子。
（2）同時將色譜柱存儲在柱盒中并放置在陰暗處，避光
10、做好氣源監測
多數情況下氣瓶與實驗室有一定的距離。對氣體鋼瓶使用情況的記錄與監測十分必要。
系統出現問題時首先需要引起注意的便是檢查氣源是否正常。
