氣相色譜儀作為精密分析儀器在石油化工、生物化學、醫藥衛生、食品工業、環保等方面應用很廣，它除用于定量和定性分析外，還能測定樣品在固定相上的分配系數、活度系數、分子量和比表面積等物理化學常數。在實際應用中不免可能存在的這樣或那樣的問題，供色譜工作者參考。
由于氣相色譜儀型號繁多、功能上差異，因此氣相色譜儀故障不一，或大或小，檢測故障的方法也不止一種：
1.觀察法
這種方法主要是通過目測觀察來發現氣相色譜儀故障，我們統稱為觀察法。觀察法主要用于檢查氣相色譜儀零件變質損壞、電路板漏焊、虛焊、線間的短路燒焦、斷線和元器件焊錯等。
2.動態觀察法
通過去觀察有關聯的波形，從而尋找故障以及排除故障的方法稱為動態觀察法。
3.靜態測量法
這主要是通過萬用表去測量線路中的直流工作電壓電流，從而確定故障。這是排除故障常用的—種方法，它對于測試線性電路尤為重要。
4.分割法
在查找故障的過程中，通過拔掉部分電路板或在電路板上斷線來逐步縮小故障的范圍，后把故障點孤立出來的方法，稱為分割法。
5.跟蹤法
在尋找故障的過程中發現一點線索，順著線索追查下去的方法稱為跟蹤法。
6.觸模法
通過觸模法（即人的手指或其他部位去觸模元器件），去發現氣相色譜儀元器件是否有過熱或應該發熱而不熱的現象(如電源變壓器及電子管等應該有發熱現象)，從而間接地判斷故障部位的方法，稱為觸模法。
7.局部受熱法
儀器由于溫度升高而發生故障，通常用局部受熱法排除。比如，其一氣相色譜儀在溫度40℃時，不能正常工作，而溫度降低后又能正常工作。此時可將儀器恢復在常溫下，用電熱吹風機或電烙鐵使其局部受熱從而發現故障所在，這稱為局部受熱法。
8.模擬法
在查尋故障過程中，可通過分別測試無故障儀器和有故障儀器的相同點，將所得的數據進行比較來確定故障的方法，稱為模擬法。
9.試探法
在查尋故障的過程中，如經測量和分析，幾種原因都能造成此種故障，那么此時，可先試探用一種方法去排除故障，如無效，再改用另一種方法試探去排除故障，這稱為試探法。
10替換法
通過更換電細線、電路板、電子管或其他部件，以確定故障在某一范圍的方法稱為替換法。
